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全基因组关联分析(genome-wide association study, GWAS)是一种在基因组水平上进行复杂性状功能基因鉴定的分析策略,已成为发掘畜禽重要经济性状候选基因的重要手段。本研究利用高密度(600K) SNP芯片,通过一般线性模型对宁海黄鸡(Gallus gallus domesticus)和广西黄鸡两个地方品种的生长和屠体性状进行了GWAS。结果显示,这两个品种鸡3、5、8和11号染色体上的4个SNP位点(rs313150871, rs314661053, rs313314400和rs314694861)及2、5、9号染色体上的3个SNP位点(rs313989383, rs317888074和rs313384732)分别与其生长性状和屠体性状显著相关(P<0.05)。其中,在5号染色体上11.80 Mb区间的1个SNP位点(rs317888074)与半净膛重和全净膛重显著相关(P<0.05),8.98～11.80 Mb之间的1个区间与0周龄重、半净膛重和全净膛重显著相关(P<0.05)。本研究初步筛选出了与宁海黄鸡和广西黄鸡生长性状相关的4个候选基因:肾上腺髓质素(adrenomedullin, ADM)、ATP/GTP结合蛋白样4 (ATP/GTP binding protein like 4, AGBL4)、激活信号协整器1复合体亚基3 (activating signal cointegrator 1 complex subunit3, ASCC3)和Wilms肿瘤1互作蛋白(wilms tumor 1 interacting protein, WTIP)基因,以及与屠体性状相关的3个候选基因:磷脂酰肌醇-4-磷酸3-激酶催化亚基2型α(phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 alpha, PIK3C2A)、丝裂原活化蛋白激酶激酶激酶13 (mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, MAP3K13)和LOC10174362(未表征的基因),为深入揭示性状遗传效应及标记辅助选种提供了理论依据。