家蚕浓核病毒中国（镇江）株结构蛋白的生物信息学比较分析

来源 :生物信息学 | 被引量 : 0次 | 上传用户：lili_mine12_5

【摘要】

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运用生物信息学方法将家蚕浓核病毒中国（镇江）株的结构蛋白与其它类型家蚕浓核病毒的结构蛋白在理化特性、结构、功能等方面进行了比较分析。结果表明：家蚕浓核病毒结构蛋白是-

【作者】

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裘智勇许光志郭锡杰

【机构】

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中国农业科学院蚕业研究所,江苏科技大学

【出处】

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生物信息学

【发表日期】

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2007年2期

【关键词】

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家蚕浓核病毒结构蛋白生物信息学 Bombyx mori Densovirus Structural Protein Bioinformatics

【基金项目】

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国家重点基础研究发展计划“973”项目（No.2005CB121004）.

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运用生物信息学方法将家蚕浓核病毒中国（镇江）株的结构蛋白与其它类型家蚕浓核病毒的结构蛋白在理化特性、结构、功能等方面进行了比较分析。结果表明：家蚕浓核病毒结构蛋白是-类稳定的亲水性蛋白，BmDNV-ZJ与BmDNV-2的结构蛋白性质可能比较类似，而BmDNV-ZJ和BmDNV-1结构蛋白序列的理化性参数、序列内部重复片断以及折叠区域差异较大，表明这两种浓核病毒结构蛋白在性状、结构、功能上有较大差异。而BmDNV-ZJ和BmDNV-1结构蛋白序列中有3个不同的LCR功能区域。分子进化聚类分析可得到四大类浓核

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