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采用直接提取土壤微生物总DNA的方法，提取苗期水稻根际土和非根际土土样微生物总DNA。用细菌通用引物扩增16SrDNA基因片段，建立克隆文库。用限制性内切酶HhaI进行PCR—RFLP分型，分别得到113个和110个酶切类型。采用多样性指数和优势细菌聚类比对方法对试验结果进行分析统计。结果表明，根际水稻土细菌的种属多样性指数、丰富度指数、均匀度指数比非根际土略高；在水稻根际土和非根际土中的优势细菌种群分别有3种具有完全相同的酶切类型，其余间存在一定的差异。