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目的:研究萸黄连炮制前后指纹图谱变化情况。方法:采用HPLC法测定萸黄连炮制前后指纹图谱变化情况,结合电喷雾电离质谱(ESI-MS)检测指纹图谱中的特征峰。结果:HPLC图谱显示炮制后萸黄连中含有黄连和吴茱萸生物碱类化学成分,从萸黄连中检测到的生物碱类成分有木兰碱、黄连碱、去氢吴茱萸碱、表小檗碱、小檗碱。应用主成分分析(PCA)法对指纹图谱进行分析,结果显示其存在差异性。结论:萸黄连炮制前后指纹图谱发生了较大的变化,增加了吴茱萸中的化学成分,为制定其质量评价方法提供重要参考。