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目的
对1例迟发性家族性噬血细胞综合征(familial hemophagocytic lymphohistiocytosis,FHL)患儿的FHL相关基因进行变异分析,明确其遗传学病因。
方法应用二代测序方法分析遗传性FHL相关的17个基因外显子及其相邻内含子连接区,明确可能与临床表型相关的基因变异,用Sanger测序进行验证及家系分析,SIFT及PolyPhen_2蛋白功能预测软件进行致病性预测。
结果患儿的PRF1基因第3外显子编码序列存在c.1349C>T(p.Thr450Met)和c.1273dupT(p.Trp425fsX457)复合杂合变异;父亲携带c.1349C>T(p.Thr450Met)杂合错义变异,其SIFT预测值为-4.921,为有害变异,Polyphen-2预测值为1.000,很可能有害,且为文献已报道过的致病性变异;母亲携带c.1273dupT(p.Trp425fsX457)杂合变异,为文献未报道过的新变异;该变异为移码变异并终止于第457位氨基酸,导致穿孔素蛋白几乎整个C2结构域(氨基酸残基413-540)及羧基末端缺失,严重影响穿孔素蛋白功能。
结论PRF1基因c.1349C>T(p.Thr450Met)和c.1273dupT(p.Trp425fsX457)复合杂合变异可能为患儿的遗传学病因,新变异的检出丰富了PRF1基因变异谱。