【摘 要】
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[目的]提出基因频率矩阵的图论多维尺度分析方法,探讨该法在人类群体遗传结构研究中的应用。[方法]从分析基因频率矩阵的结构特征入手,将增强多维尺度分析与图论中的最小生成
【机 构】
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山东省平邑县卫生防疫站,山东大学公共立生学院流行病学与医学统计学研究所,山东大学医学院医学遗传学研究所
【基金项目】
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国家自然科学基金资助项目(No.30170527)
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[目的]提出基因频率矩阵的图论多维尺度分析方法,探讨该法在人类群体遗传结构研究中的应用。[方法]从分析基因频率矩阵的结构特征入手,将增强多维尺度分析与图论中的最小生成树有机结合,构建人类群体遗传结构的图论多维尺度模型,并以中国26个汉族人群HLA-A基因座遗传结构分析为例,验证图论多维尺度分析的科学性和适用性。[结果]图论多维尺度分析的基本步骤可概括为:①对中心化基因频率矩阵进行增强多维尺度分析;②按图论原理求过m维空间n个点的最小生成树;③利用求“颈”法分割最小生成树;④将最小生成树整合到增强多维尺度散点图中构建图论多维尺度分类图。根据此步骤,对中国26个汉族人群HLA-A基因座遗传结构进行了图论多维尺度分析,分析结果符合中华民族源与流的客观规律。[结论]图论多维尺度分类图既可显示各群体的遗传结构特性,又可利用最小生成树的连接关系揭示各群体间的内在联系;图论多维尺度分析是分析人类群体遗传结构的一种理想方法。
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