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利用微卫星和RAPD标记技术对3个黄河鲤群体进行遗传多样性分析，5个随机引物扩增出33个位点，多态位点比例为69．7％，Shannon信息指数为0．3910。在4个微卫星座位上共检测出17个等位基因，多态信息含量在0．49～0．75之间。伊洛河环境相对较开放，在样本量较小的情况下该群体仍表现出一定的多样性；天然文岩渠则是一个半封闭的水域，取自该水域的群体在3个群体中遗传多样性水平处于中等。预选黄河鲤群体是一个经过长达20多年人工选择的群体，该群体面临的选择压力远大于2个自然群体，表现为各位点均显著偏离了H