【摘 要】
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为发掘出一批香蕉的SNP位点、进一步研究香蕉的遗传关系、相关性状的定位等打下基础,从美国国立生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)的db
【机 构】
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中国热带农业科学院热带作物生物技术研究所/农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室,南京农业大学园艺学院,中国热带农业科学院海口实验站/海南省香蕉遗传改良重点实验室
【基金项目】
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海南省重点研发计划(编号:ZDYF2018097);国家自然科学基金(编号:31501043);国家现代农业产业技术体系建设专项(编号:CARS-31);中央级公益性科研院所基本科研业务费项目(编号:1630052017018)
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为发掘出一批香蕉的SNP位点、进一步研究香蕉的遗传关系、相关性状的定位等打下基础,从美国国立生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)的dbEST数据库下载46665条香蕉EST序列,经生物信息学方法分析发掘EST-SNP位点,并对其所在核酸序列进行功能注释分析。通过对46665条EST进行拼接,共得到3490条重叠群(contigs),在含有4条以上重叠群中发现有39条重叠群中含有SNP位点,从中筛选出127个候选SNP位点,
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