【摘 要】
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目的:利用新一代测序技术鉴定1例脑膜炎患者脑脊液中分离培养的单核细胞增生李斯特菌(LM),并进行基因组进化和耐药性分析,探讨患者病情迅速进展和治疗失败的原因。方法:从该
【基金项目】
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国家自然科学基金青年基金项目(81801295)
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目的:利用新一代测序技术鉴定1例脑膜炎患者脑脊液中分离培养的单核细胞增生李斯特菌(LM),并进行基因组进化和耐药性分析,探讨患者病情迅速进展和治疗失败的原因。方法:从该例脑膜炎患者脑脊液中培养、分离并鉴定出LM,采用Illumina HiSeq 3000系统进行细菌De novo测序,利用基因组装、基因预测、基因注释、单核苷酸多态性(SNP)分析和系统进化分析等生物信息学方法,构建LM属的进化树,并进行耐药基因分析。结果:患者脑脊液细菌分离培养,经质谱法鉴定为LM;经过测序,数据组装细菌基因组大小为300
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