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2016年我国农作物重大病虫害总体为中等发生年份。受超强厄尔尼诺影响，南方大部地区汛期提前、极端天气增多，小麦赤霉病、穗期蚜虫发生较重，稻飞虱、稻纵卷叶螟、稻瘟病发生早、繁殖快、扩散范围广，对水稻生产构成严重威胁；玉米病虫害发生相对平稳，玉米粘虫在局部地区点片严重发生；棉铃虫、玉米蚜虫在北方大部分区域偏重发生；二点委夜蛾在河北和山东偏重发生；马铃薯晚疫病在华北、西北、西南部分区域偏重发生。