应用16S rDNA测序技术动态监测早产儿使用抗生素前后肠道微生物菌群的变化,以探讨抗生素应用对早产儿肠道微生态的影响。
方法选取本院2015年9月至2016年2月期间,生后即入住新生儿科的早产儿19例,于生后1 d内,以及生后第2或3周分别收集粪便标本各1次。根据生后抗生素使用时间分为短期抗生素组(<3 d)10例和长期抗生素组(>7 d)9例。采用高通量测序仪Hiseq 2500对粪便样品进行测序,获得样本中细菌组成、物种丰度、系统进化、群落比较信息。采用独立样本t检验或Fisher精确概率法对数据进行统计学分析。
结果(1)2组早产儿一般资料比较差异无统计学意义。(2)抗生素应用前的菌种组成以乳球菌属、肠球菌属和杆菌属为主(分别占36.41%、23.40%和14.98%);应用后菌种组成以肠球菌属为主(16.73%),而乳球菌属与杆菌属的比例明显下降(分别为1.73%和1.25%)(P值均<0.01)。同时,葡萄球菌属、梭菌属和双歧杆菌属比例上升。(3)应用抗生素后,短期和长期抗生素组的Shannon指数明显降低[应用前后分别为(2.34±0.84)与(1.06±0.96)和(2.64±1.04)与(0.35±0.36),P值均<0.05],而Chao1指数、检测物种数指数和谱系多样性指数也显现相应趋势,组内差异有统计学意义(P值均<0.05)。(4)Beta多样性分析发现,在抗生素应用前,2组微生物群落聚集性较高;而2组组内抗生素应用后聚集性降低。(5)Anosim相似性分析发现,短期和长期抗生素组内在应用抗生素前后比较,肠道菌群构成差异均有统计学意义(R值分别为0.555和0.733,P值均=0.001);但应用抗生素后2组间比较,差异无统计学意义(R=0.060,P=0.138)。
结论抗生素的应用可明显改变早产儿肠道菌群的分布,生后短期使用抗生素即可显著改变早产儿肠道微生态的多样性。这一影响可能随抗生素使用时间延长而加重。提示临床应慎重使用抗生素,包括经验性短期使用抗生素。