猪基质Gla蛋白基因序列多态及生物信息学分析

来源 :生物技术通报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：hexqi666

【摘要】

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选择具有明显品种差异的3个猪品种（可乐猪、白香猪和大约克）构建品种DNA池,采用PCR产物直接测序法研究公猪MGP基因5′侧翼调控区、外显子1共1 112 bp范围内可能与精液品质相关

【作者】

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李敬瑞向程举刘章忠张义玲刘若余

【机构】

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贵州大学动物科学学院高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,毕节地区畜牧技术推广站

【出处】

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生物技术通报

【发表日期】

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2011年8期

【关键词】

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DNA池 SNPS MGP基因 5′调控区生物信息学 DNA pooling SNPs MGP gene 5′UTR Bioinformatics

【基金项目】

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贵州省农业科技攻关项目[黔科合NY字（2009）3073]

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选择具有明显品种差异的3个猪品种（可乐猪、白香猪和大约克）构建品种DNA池,采用PCR产物直接测序法研究公猪MGP基因5′侧翼调控区、外显子1共1 112 bp范围内可能与精液品质相关的序列多态性,快速筛查到两个SNPs（C-849T、C-895T）。进一步利用生物信息学分析MGP基因5′侧翼调控序列。预测出评分为95分以上的转录因子结合位点有31个,发现了CpG岛。C-849T和C-895T的变异则使白香猪比可乐猪和大约克多出了两个HSF可能的结合位点（85.9分）。1个TATA可能的结合位点（91.4

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