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基于复杂网络研究蛋白质界面网络中的模体和模块，发现蛋白质界面网络与蛋白质肽链网络的拓扑性质有差异．蛋白质界面网络中的模体类型和数量受截断距离R影响较大，R值不同，网络中的模体类型和数量都有较大差别．蛋白质界面网络中存在模块结构，分析R为0．5，0．7，1．2，2．4nm时网络中存在的3-派系-模块，发现当R为0．7nm时的蛋白质界面网络模块划分比较符合实际．最后，分析蛋白质界面网络中的模块与其拓扑性质的关系，发现界面网络中的节点数与3-派系-模块数呈线性关系．