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分析了不同DNA浓度、Mg^2＋、dNTP、引物用量对朱砂根ISSR-PCR扩增结果的影响，确立适合朱砂根的ISSR反应体系为：在20μl反应体系中，含1×buffer、30ng模板DNA、随机引物量0.4μmol/L、dNTP0.15 mmol/L、Mg^2＋1.75 mmol/L、1UTaq DNA聚合酶。