【摘 要】
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采用基于贝叶斯网络的建模方法,预测真核生物DNA序列中的剪接位点.分别建立了供体位点和受体位点模型,并根据两种位点的生物学特性,对模型的拓扑结构和上下游节点的选择进行
【机 构】
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中国科学技术大学生物医学工程研究所
【基金项目】
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中国科学院知识创新工程项目，中国科技大学校科研和教改项目
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采用基于贝叶斯网络的建模方法,预测真核生物DNA序列中的剪接位点.分别建立了供体位点和受体位点模型,并根据两种位点的生物学特性,对模型的拓扑结构和上下游节点的选择进行了优化.通过贝叶斯网络的最大似然学习算法求出模型参数后,利用10分组交互验证方法对测试数据进行剪接位点预测.结果显示,受体位点的平均预测准确率为92.5%,伪受体位点的平均预测准确率为94.0%,供体位点的平均预测准确率为92.3%伪供体位点的平均预测准确率为93.5%,整体效果要好于基于使用独立和条件概率矩阵、以及隐Markov模型的预测方
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