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神经系统损伤后，中枢与末梢损伤的局部微环境不同是造成两者出现再生差异的主要原因。巨噬细胞和小胶质细胞的功能状态决定了免疫应答反应的程度和细胞素释放的水平，从而影响了损伤局部的微环境。此外，神经细胞的凋亡亦是脑缺血损伤后导致神经元死亡的类型之一。一些原癌基因在损伤早期的表达，是抑制凋亡的重要基因。