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于2019年4月20日、7月20日、10月20日和2020年1月20日,在该公园的各湖泊中,共设置了11个采样点,采集浮游植物样品,鉴定浮游植物物种,确定优势种,计算浮游植物生物量、密度和物种多样性指数,评价湖泊水质。研究结果表明,在宁夏太阳山国家湿地公园湖泊中,共发现浮游植物5门37属46种,其中硅藻门的物种数占总物种数的39.1%,绿藻门的物种数占23.9%,蓝藻门的物种数占19.6%;2019年4月20日,各湖泊中浮游植物群落的优势种都为硅藻,2019年7月20日和10月20日,各湖泊浮游植物群落的