5SrRNA互作蛋白组研究揭示 5S rRNA参与mRNA剪接调控

来源 :中山大学学报:自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户：yufengdetianxia

【摘要】

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为系统揭示5SrRNA调控细胞进程的新功能和分子机制,合成了生物素标记探针,利用分子杂交技术特异捕获5SrRBP,并结合高灵敏度质谱技术和生物信息学分析共鉴定出162个5SrRNA互作

【作者】

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周祥明杨兵赖巧李乐董军廖建友朱爽

【机构】

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广东药科大学生命科学与生物制药学院,中山大学孙逸仙纪念医院

【出处】

：

中山大学学报:自然科学版

【发表日期】

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2019年3期

【关键词】

：

5SrRNA ChIRP-MS 互作蛋白组 mRNA剪接 5S rRNAChIRP-MSinteractomemRNA splicing

【基金项目】

：

广东省恶性肿瘤表观遗传与基因调控重点实验室基金(2017B030314026),广东省科技计划项目(2017A030313066),广东省自然科学基金(2016A020221037),国家自然科学基金(41271263).

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为系统揭示5SrRNA调控细胞进程的新功能和分子机制,合成了生物素标记探针,利用分子杂交技术特异捕获5SrRBP,并结合高灵敏度质谱技术和生物信息学分析共鉴定出162个5SrRNA互作蛋白。基于ConsensusPathDB和STRING数据库获取蛋白复合体富集信息和构建蛋白与蛋白互作网络,利用GO数据库获取互作蛋白的功能注释,利用KEGG数据库进行通路富集分析。分析结果显示5SrRNA除了与翻译相关蛋白发生互作外,还与大量来自microRNA加工通路、mRNA剪接通路和细胞信号调控通路蛋白有互作。这说明

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