【摘 要】
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探讨了线性离子阱-傅立叶变换离子回旋共振质谱（LTQ-FT）的数据采集模式对蛋白质组鉴定结果的影响,比较和分析了针对不同复杂程度样本的最佳采集模式。对于α-乳清蛋白4种标准蛋
【机 构】
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军事医学科学院放射与辐射医学研究所
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探讨了线性离子阱-傅立叶变换离子回旋共振质谱（LTQ-FT）的数据采集模式对蛋白质组鉴定结果的影响,比较和分析了针对不同复杂程度样本的最佳采集模式。对于α-乳清蛋白4种标准蛋白质酶切肽段混合物的简单体系,在傅立叶变换离子回旋共振腔中选3个最强母离子进行选择离子监测扫描后,再实施二级碎裂的方法（SIM3）得到的肽段覆盖率,分别是直接选10个最强母离子进行二级碎裂（FT10）方法得到的肽段覆盖率的1.5～1.9倍。另外,对酵母蛋白酶切肽段混合物的复杂体系鉴定时,只采集双电荷和三电荷母离子进行二级扫描的方法（FT1023）比单电荷、双电荷和三电荷都采集的方法（FT10123）得到的图谱鉴定成功率提高64.1%。实验还对不同数据采集模式下图谱的特点进行了考察。本研究表明,针对不同复杂程度的样本,应采取不同的质谱数据采集方法。
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