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本文从医院科室运营分析存在的问题入手,分析出这些问题的成因是财务人员的惯性思维和缺乏对统计工具的应用造成的;从医院应用角度出发,对波士顿矩阵进行改造和优化,并以某医院为例,示范了怎样将优化后的波士顿矩阵应用到医院运营分析中,对波士顿矩阵的指标体系和应用过程中的特殊情况处理做了进一步探讨。