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以当前国内最具影响力的四所高等教育研究机构——清华大学教育研究院、北京大学教育学院、华中科技大学教育科学院、厦门大学教育研究院为研究样本，分别从合作强度、影响力、合作机构三方面对这四所机构跨学科合作现状进行比较评估。研究认为高等教育研究机构跨学科科研合作的广度还需不断拓宽；合作机构的选择受地缘影响较大，应努力克服地域局限；合作学科的选择受院校优势学科影响，应充分发挥优势学科的带动作用。