【摘 要】
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目的 运用生物信息学分析,探讨硫利达嗪抗宫颈癌的潜在作用机制.方法 通过PharmMapper工具预测能够与硫利达嗪相互作用的靶基因,然后使用STRING在线工具对靶基因进行通路和组织表达富集分析.使用GeneCards和DisGeNET数据库筛选宫颈癌相关基因,与硫利达嗪的靶基因取交集,得到硫利达嗪可能作用于宫颈癌的交互基因.通过STRING构建蛋白互作(PPI)网络,推测核心靶点,评估其重要性.使用clusterProfiler软件进行GO和KEGG通路分析.结果 通过PharmMapper预测得到4
【机 构】
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昆明医科大学生物医学工程研究院暨云南省干细胞和再生医学重点实验室,云南昆明 650500
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目的 运用生物信息学分析,探讨硫利达嗪抗宫颈癌的潜在作用机制.方法 通过PharmMapper工具预测能够与硫利达嗪相互作用的靶基因,然后使用STRING在线工具对靶基因进行通路和组织表达富集分析.使用GeneCards和DisGeNET数据库筛选宫颈癌相关基因,与硫利达嗪的靶基因取交集,得到硫利达嗪可能作用于宫颈癌的交互基因.通过STRING构建蛋白互作(PPI)网络,推测核心靶点,评估其重要性.使用clusterProfiler软件进行GO和KEGG通路分析.结果 通过PharmMapper预测得到47个靶基因,富集到肿瘤相关通路和宫颈癌细胞.与669个宫颈癌基因取交集,获得硫利达嗪和宫颈癌交互基因21个,其中10个关键节点基因为EGFR、PPARG、AR、NOS3、ALB、ESR1、MAPK1、MAPK14、ANXA5和MAPK8,且在宫颈癌PPI网络中处于重要位置.交互基因涉及到的生物进程主要有负离子转运的正调控、丝氨酸肽基磷酸化、类固醇代谢过程、血液凝固、细胞对化学应激的反应等.富集的KEGG通路包括调控癌症通路、松弛素信号通路、内分泌耐药、蛋白聚糖与肿瘤、细胞衰老、GnRH信号通路和VEGF信号通路等.结论 硫利达嗪具有潜在的抗肿瘤作用,可能通过多靶点和多信号通路的方式在宫颈癌的治疗上发挥作用.
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