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历史上被称为"疠疫"的瘟疫疾病在北京几乎常年发生,只是轻重不同,统治者历来重视京城防疫。清代北京的防疫卫生体系经历了从传统向近代的过渡阶段。清前期,京城防疫卫生主要由官办的太医院、临时设立的五城药局,以及民间的善堂、药铺承担。至清末,清政府在参酌西方经验的基础上,初步建立了近代形态的防疫卫生体系。