2018-2019年度驻马店市新甲型H1N1流感病毒HA分子特征

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目的 了解2018-2019年度驻马店市新甲型H1N1流感病毒的流行和HA基因进化特征、抗原及受体结合位点等变异情况.方法选取2018-2019年度驻马店市分离的6株新甲型H1N1流感病毒株,提取病毒核酸后对HA基因进行测序,利用生物信息学软件MEGA 6.0分析HA基因上基因序列特征及变化情况进行分析.结果驻马店市新甲型H1N1流行株与WHO参考株的HA基因序列差异较小,与A/California/07/2009参考株核苷酸和氨基酸同源性分别为96.30%~96.80%、96.20%~96.50%,与同期疫苗株A/Brisbane/02/2018核苷酸和氨基酸同源性分别为98.80%~99.20%、98.40%~98.70%.驻马店市流行株在HA基因抗原决定簇上有6处氨基酸变异,分别在Ca区的S203T,Cb区的 S74R,Sa 区的 S162N、K163Q、S164T,Sb 区的 S185T;在受体结合部位 130环 H138Y、220环 D222N、220环 Q223R 发生氨基酸位点的变异.结论2018-2019年度驻马店市新甲型H1N1流行株与WHO推荐疫苗株具有高度同源性.HA基因抗原决定簇和受体结合部位等关键的氨基酸位点发生变异,应加强监测及时发现变异毒株,为流感防控提供科学的依据.
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