【摘 要】
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本研究对长蕊甜菜树转录组文库中SSR位点的发生频率、平均分布距离、重复基元类型等进行统计分析。在147 990条去冗余的Unigene中，有129 734个微卫星位点分布于50 991条序列中，总发生频率为34.46%，平均每1.57 kb就会出现1个SSR位点。在微卫星位点中共有113种重复基元，主要的重复类型是二核苷酸（37.55%）和单核苷酸（26.86%），其中AG/CT和A/T分别是二核
【机 构】
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西南林业大学云南省高校林木遗传改良与繁育重点实验室云南森林资源培育与利用协同创新中心
【基金项目】
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国家林业和草原局林业科技发展项目（KJZXSA2019036）资助；
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本研究对长蕊甜菜树转录组文库中SSR位点的发生频率、平均分布距离、重复基元类型等进行统计分析。在147 990条去冗余的Unigene中，有129 734个微卫星位点分布于50 991条序列中，总发生频率为34.46%，平均每1.57 kb就会出现1个SSR位点。在微卫星位点中共有113种重复基元，主要的重复类型是二核苷酸（37.55%）和单核苷酸（26.86%），其中AG/CT和A/T分别是二核苷酸和单核苷酸的优势重复基元，占总SSR位点的43.34%。SSR的重复次数以5～10次为主，占总SSR位点的70.92%，当重复次数为6时，二至六核苷酸数量最多，占总SSR的18.25%。SSR重复序列的长度为10～90 bp，平均长度为19.29 bp，基序长度10～20 bp的占总数的70.53%，在各重复单元中，当序列长度增加时，SSR的出现频率也随之下降。该研究结果为长蕊甜菜树后续的SSR标记开发、种质资源鉴定和遗传多样性分析等奠定了理论基础。
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