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六盘山位于陕甘宁交接地区，属于半湿润气候向半干旱气候的过渡带，是黄土高原生物多样性最丰富的地区之一，有维管植物836种，隶属于93科，359属。本区属于泛北极植物区、中国-日本森林植物亚区、华北植物地区的黄土高原亚地区。全部种子植物可分为13个分布区类型和12个变型，以北温带分布类型为主，与其他植物区系联系广泛，但特有属较贫乏。六盘山与小陇山、太白山和中条山的属相似性系数较高，均达60％以上，表明几座山体处于相似的生物气候背景之下，地理隔离性不明显。与贺兰山的属相似性系数低于60％，因为贺兰山位于干旱的荒