高粱EST-SSR标记的建立及其在苏丹草中的应用初探

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从NCBI中下载了202325条高粱Sorghum bicolor EST序列。去除低质量和冗余的序列后,在5661条高粱EST中共发掘出了6663个SSR位点,出现频率是20.19%,平均分布频率是1/3.93kb。在5197条EST序列中,共有3446条序列能够设计引物,占总数的66.3%。在高粱EST-SSR中,三核苷酸重复是主要的重复类型,出现最多的重复基元是GGC/GCC。在3446对高粱EST—SSR引物中,随机选择了20对引物进行了合成。以苏丹草Sorghum sudanense722和高梁
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