猪流行性腹泻病毒山西分离株全基因组序列分析

来源 :动物医学进展 | 被引量 : 0次 | 上传用户：csxna

【摘要】

：

用RT-PCR扩增分离的一株PEDVCH-SXCH11-2015的全基因组序列，测序拼接后，进行了序列分析。CH-SXCH11-2015全长28038bp比CV777长5bp，与BJ-2011-1同源性最高，为98．9％；与LZC、SM98同源性

【作者】

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刘文俊樊振华王娟萍姚敬明吴忻孟帆韩一超薛翼鹏

【机构】

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山西省农业科学院畜牧兽医研究所

【出处】

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动物医学进展

【发表日期】

：

2017年6期

【关键词】

：

猪流行性腹泻病毒全基因组序列序列分析 Porcine epidemic diarrhea virus complete genome sequence

【基金项目】

：

山西省科技攻关项目（20140311020-2-A）,山西省科技攻关项目（20150311018-3）

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用RT-PCR扩增分离的一株PEDVCH-SXCH11-2015的全基因组序列，测序拼接后，进行了序列分析。CH-SXCH11-2015全长28038bp比CV777长5bp，与BJ-2011-1同源性最高，为98．9％；与LZC、SM98同源性最低，为96．6％。S基因全长均为4161bp，突变主要发生在S1区，同源性分析表明，CH-SXCH11-2015核苷酸同源性与BJ-2011-1和CH／ZJJS-Z／2012的最高为98．9％，与SM98同源性最低为93．6％，与CV777、CV777vacci

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