【摘 要】
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EST-SSR标记与gSSR标记是2种重要的分子标记,烟草EST序列数量与基因组序列数量的迅速增加为开发新的烟草分子标记提供了宝贵的数据资源。对GenBank上公布的158 098条EST序列
【机 构】
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山西农业大学农学院,鲁东大学生命科学院
【基金项目】
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国家自然科学基金项目(30800682), 教育部科技重点项目(2002-03),教育部归国留学人员科研基金项目(2001-11), 山西农业大学科技创新基金项目(2006025)
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EST-SSR标记与gSSR标记是2种重要的分子标记,烟草EST序列数量与基因组序列数量的迅速增加为开发新的烟草分子标记提供了宝贵的数据资源。对GenBank上公布的158 098条EST序列及10 647条GSS序列进行大规模微卫星位点搜索,在EST中发现了8 088个微卫星位点(检出率为5.1%),在GSS中发现了2 020个微卫星位点(检出率为18.9%)。在EST中搜索到的重复单元共有176种,其中二核苷酸占主导地位,占到总SSR的近66%,出现次数在1~100之间的基序超过所有基序的90%;在G
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