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背景甲氧西林耐药金黄色葡萄球茵（MRSA）的分离株属单一谱系，现有的分型技术还无法对其进行辨认。全基因测序可提高辨认能力以确定传播途径及暴发特性。方法对某新生儿重症监护室假定暴发的MRSA进行了调查。采用快速高通量测序技术，以满足临床对出报告时间的需求。对与暴发有关的7个分离株及同一家医院携带MRSA或茵血症相关的7个分离株的DNA进行回顾性排序。结果通过对核心基因组与参照基因组的单核苷酸多态性的比较[流行性MRSA克隆、EMRSA一15（序列类型22）]构建了种系树。揭示了暴发分离株为独特群簇，这些分离