【摘 要】
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目的采用生信分析技术探讨二叶式主动脉瓣(BAV)钙化相关的关键基因(hub基因)。方法从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中下载BAV相关的基因表达矩阵及临床数据,应用Perl及R软件筛选出钙化的BAV与正常主动脉瓣的差异基因(DEGs),通过R软件对DEGs进行富集分析,使用Cytoscape构建蛋白质互作(PPI)网络。使用Degree算法计算并取排名前10的DEGs作为hub基因,分别采用miRWalk数据库及FunRich软件预测hub基因对应的microRNA并取交集
【机 构】
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南京医科大学第一附属医院心脏大血管外科,南京医科大学第一附属医院泌尿外科
【基金项目】
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国家自然科学基金面上项目(81974033)。
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目的采用生信分析技术探讨二叶式主动脉瓣(BAV)钙化相关的关键基因(hub基因)。方法从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中下载BAV相关的基因表达矩阵及临床数据,应用Perl及R软件筛选出钙化的BAV与正常主动脉瓣的差异基因(DEGs),通过R软件对DEGs进行富集分析,使用Cytoscape构建蛋白质互作(PPI)网络。使用Degree算法计算并取排名前10的DEGs作为hub基因,分别采用miRWalk数据库及FunRich软件预测hub基因对应的microRNA并取交集
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