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文章旨在探索一种电子应急系统中的保密通信设计，实现信息的接警处警以及数据整合，并注重数据的管理和联动查询过程。通过对应急系统各个部门信息的流向关系进行分析，将电子应急系统中的保密通信模型给出，这种保密通信模型不仅仅存在长消息模型，同时也存在短消息模型。在电子应急系统中，结合加密算法的优缺点，提出一种EIGamal公钥加密算法，并提出一种IDEA私钥加密算法，做好长消息以及短消息的有效性加密。结合保密通信的一种加密算法实现过程。结果表明，完成了数据的安全通信。