【摘 要】
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中间丝蛋白是组成细胞骨架的3种主要成分之一,在维持细胞正常形态和细胞内物质定向转运等方面发挥重要作用.为探究中间丝蛋白在瘤背石磺形变能力和损伤后修复过程中是否发挥相应作用,通过运用RACE法克隆获得瘤背石磺(Onchidium reevesii)中间丝蛋白基因的cDNA全长序列,并对其进行生物信息学分析和RT-qRCR试验.结果 显示,瘤背石磺(Onchidium reevesii)中间丝蛋白基因序列全长为1957 bp,序列分析表明,Os-IF1可以编码452个氨基酸,ORF总长度为1359 bp,两端
【机 构】
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上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心,水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室,海洋动物系统分类与进化上海高校重点实验室,上海,201306
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中间丝蛋白是组成细胞骨架的3种主要成分之一,在维持细胞正常形态和细胞内物质定向转运等方面发挥重要作用.为探究中间丝蛋白在瘤背石磺形变能力和损伤后修复过程中是否发挥相应作用,通过运用RACE法克隆获得瘤背石磺(Onchidium reevesii)中间丝蛋白基因的cDNA全长序列,并对其进行生物信息学分析和RT-qRCR试验.结果 显示,瘤背石磺(Onchidium reevesii)中间丝蛋白基因序列全长为1957 bp,序列分析表明,Os-IF1可以编码452个氨基酸,ORF总长度为1359 bp,两端非编码区域长度分别是376 bp(5\'端)和220 bp(3\'端);根据理论分子量(51.54 kD)和等电点(5.21)数据显示其是一个偏酸性的蛋白质;二级结构和三级结构预测结果均显示在多肽链的中间位置存在非常保守的α螺旋结构域,完全符合中间丝蛋白家族的哑铃状构型.荧光定量PCR分析结果表明,该基因广泛分布在石磺各组织中;通过人为损伤4种石磺背部组织,比较了4种石磺不同组织中该基因的表达差异,试验结果表明该基因在4种石磺表皮损伤修复过程中也发挥一定的作用.本研究以期为进一步探究瘤背石磺运动及环境适应性提供基础数据,并为探讨无脊椎动物皮肤组织从水生到陆生环境的适应机制提供有价值的分子依据.
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