蓖麻RcNHX2基因克隆与生物信息学分析

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液泡膜型钠氢逆向转运蛋白(Tonoplast Na+/H+ antiporters,NHX)在植物耐盐方面具有重要意义.本研究利用RACE方法克隆了蓖麻RcNHX2基因的3'端和5'端片段.最后设计全长引物获得蓖麻RcNHX2全长序列,并对其进行生物信息学分析.结果表明,蓖麻液泡膜型钠氢逆向转运蛋白基因的cDNA完整的开放阅读框序列为1 626 bp,推测其可编码541个氨基酸;含有典型的液泡膜型钠氢逆向转运蛋白典型的Na+/H+交换泵(50NES52)和氨氯吡嗪咪的结合位点(84LFFIYLLPpI93);存在12个跨膜结构域,属于跨膜蛋白;预测其定位于细胞质膜和液泡膜及内质网膜.
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