１９１０年１１月９日，哈尔滨地区突发鼠疫，灾祸首发于傅家甸（今道外区）。可怕的肺鼠疫由沙俄西伯利亚传入我国满洲里，很快延及哈尔滨，危及东北全境。疫情严重，蔓延迅速，市内每天平均死亡５０余人，最多一天死亡１８３人。这是发生在哈尔滨的第一次大鼠疫。
　　死神笼罩着哈尔滨，人们一时惊恐不安，染疫市民的生命朝夕不保，地方官吏不断向清廷告急。
　　１９１０年，正值辛亥革命的前夜，清政府内忧外患处于风雨飘摇中，本无心顾及东北臣民的死活，但又不能不做出施以“恩泽”的姿态，遂“电告东三省要全力驰救”。未几，令旅居东北的法国医师摩赛尼赴哈防治“时疫”。赴哈不久，这位洋医师在给病人检疫时受传染，不治身亡。后来人死得越来越多，全城棺木奇缺，继之出殡者取苇蓆、草袋盛殓，到最后只能将死者抬到雪地停尸，等待地方官府处理。
　　东北疫情告急，大有往关内蔓延之趋势，引起清廷的重视。急令内务部在全国求贤降伏鼠疫，救民于水火。内务部官员施肇基推荐曾获英国剑桥大学医学博士的防治传染病专家伍连德担此大任。
　　伍连德时年３１岁，当时正在天津帝国陆军军医学堂副监督的任上，遂被委任“全权总官”，全面负责鼠疫防治工作。
　　伍氏临危受命，星夜兼程赶赴哈尔滨。事后他写的回忆录披露了大鼠疫的死亡情况：“余到坟地视察，见到２０００具棺材和大量来不及掩埋的尸体，在雪地上排列着，真是触目惊心，惨不忍睹……”当时他心情沉重，深感责任重大。
　　伍氏率防治人员急速投入紧张的防疫工作中，夜以继日，尽职尽责。医务人员冒着生命危险，深入疫区，调查疫情，寻找病源；同时，采取控制交通、隔离疫区和患者，火化病尸，组织防疫队对症施药等得力措施，终于在１２０天内扑灭了这场震惊世界的烈性传染病。
　　清政府为表彰伍连德的医德医术，特恩赐医科进士功名，授予陆军兰领军衔。１９１１年，伍连德任东三省防疫处处长。由于他的积极努力，东三省的防疫机构得以组建、加强，专业人员陆续充实到防疫队伍，负责监视检查疫区，并在滨江、满洲里、齐齐哈尔、拉哈建起４所直辖医院，平时应诊，疫时防疫。１９２０年鼠疫再度发生，疫情得以及时控制，死亡率明显下降，这得利于上述防治体系以及有力的灭疫措施发挥了作用。
　　１９１１年８月，伍连德代表中国出席在英国伦敦召开的国际医学大会，伍氏在会上发表了《蒙古鼠与瘟疫的关系之考察》的论文，介绍了防治鼠疫的经验，备受学术界推崇，被誉为近世制服大面积鼠疫流行的第一人。
　　伍连德不但医术精良为人称道，更有一颗爱国济世的赤子之心。１９１５年，日本帝国主义提出灭亡中国的二十一条，激起中华民族的义愤，举国暴发反日风潮。哈尔滨工人张泰在反日救国的集会上激愤演讲，号召国人不做亡国奴，并刺穿腹部，血书“誓死报国”明志。对此壮举伍连德深受感动，迅速将张泰收留入滨江医院，免费给予精心治疗，使之很快康复。１９２５年，哈市各界群众为声援上海“五卅”惨案受难同胞举行义演，伍氏作为爱国人士，应邀登台演出受到称赞。北伐战争时，蒋介石多次邀请他以陆军医务部主任的官衔赴任。他不为名利所动，仍坚持工作在防疫科研的第一线。正是对医学事业的痴情，他一生有多部著述问世，如《霍乱概论》、《鼠疫概论》、《论肺型鼠疫》、《中国医史》（与他人合著）等。某些医学理论观点和防治疫情措施至今仍有指导作用。
　　伍连德祖籍广东新宁，父辈为马来西亚华侨。晚年他返归马来西亚定居，将北京东城故居捐赠给中华医学会，以表爱国敬医之心。１９６０年，他以８１岁高龄辞世，长眠于宝岛槟榔屿，了却了他身后要“落叶归根”的夙愿。