【摘 要】
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为研究烟草丙酮酸脱羧酶家族特性,运用ProtScale、CDD、Interpro、Muscle、phyml和TreeDyn等工具分析烟草丙酮酸脱羧酶家族各成员的亲疏水性、结构域和进化树.结果 表明:NtPD
【机 构】
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大理州烟草公司永平县分公司,云南永平,672100大理州烟草公司鹤庆县分公司云南鹤庆672100;大理州烟草公司剑川县分公司,云南剑川,671300;大理州烟草公司魏山县分公司,云南魏山,672400
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为研究烟草丙酮酸脱羧酶家族特性,运用ProtScale、CDD、Interpro、Muscle、phyml和TreeDyn等工具分析烟草丙酮酸脱羧酶家族各成员的亲疏水性、结构域和进化树.结果 表明:NtPDC_1和NtPDC_2具有亲水性,属于可溶性蛋白,NtPDC_3,NtPDC_4,NtPDC_5和NtPDC_6具有疏水性,为非可溶性蛋白;烟草丙酮酸脱羧酶属于硫胺素焦磷酸(TPP)依赖性酶超家族,各成员均含有3组结构域,分别为N-末端TPP结构域、中心域和C-末端TPP结构域;烟草、拟南芥、水稻、薏苡和玉米的丙酮酸脱羧酶聚类为4组,其中烟草丙酮酸脱羧酶主要聚集在Ⅰ组和Ⅱ组,其进化相对保守.
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