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在反义实验中成功的关键是选择合适的靶位点.但是,由于RNA折叠形成二级结构,会使大多数互补的核酸不能接近并形成分子间的碱基配对,因此这种选择非常困难.通常采用的方法,如"序列步移"或计算机辅助设计,并未获得显著的成功.为此,本文总结了几个经验选择方法,特别是基于转录物的RNase H图谱和寡核苷酸芯片扫描的方法.