大豆GmbHLH041基因的生物信息学分析及对镉胁迫的响应

来源 :华北农学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:dgfm1028
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
为探讨大豆Gmb HLH041转录因子在应答镉胁迫中的作用,根据前期的镉胁迫前后大豆根系转录组测序结果,筛选获得响应Cd胁迫的Gmb HLH041基因,利用NCBI和Phytozome数据库,结合生物信息学软件对Gmb HLH041基因进行预测分析,并通过q RT-PCR的方法检测大豆根系中Gmb HLH041基因在50μmol/L Cd SO4胁迫0,24 h的表达情况。结果显示,Gmb HLH041基因编码542个氨基酸,相对分子质量为61.17 ku,理论等电点为5.89。二级结构预测结果显示,该氨基酸序列主要以无规则卷曲(39.48%)、α-螺旋(37.27%)和伸展链(16.61%)的形式存在,从拟南芥b HLH家族中的12个亚家族中挑选了24个b HLH蛋白并结合其他物种中亲缘关系较近的b HLH蛋白,对Gmb HLH041进行系统进化树分析发现,Gmb HLH041与野生大豆和狭叶羽扇豆的b HLH041蛋白亲缘关系较近,Gmb HLH041划分到拟南芥b HLH家族第4亚族Ⅳd中。根据进化树的分析结果,选取与Gmb HLH041亲缘关系最近的Gsb HLH041、Lab HLH041以及拟南芥第4亚族Ⅳd中的AT5G56960进行多重比对,结果显示,Gmb HLH041含有一个保守的b HLH结构域;荧光定量PCR结果显示,Gmb HLH041基因在50μmol/L Cd SO4胁迫24 h后表达量极显著上升,说明Gmb HLH041基因在Cd胁迫应答中可能发挥着重要的作用。
其他文献
【摘要】素质教育的新理念下越来越重视数学思想方法在小学教学中的融入和运用,数学思想方法的作用发挥也愈加明显和重要.数学思想方法是推进数学素质教育的重要基础,也有效满足了新的课程改革要求.教师在小学数学的教学实践中,除了教授数字知识外,更要坚持以数学教材为依托,加强对数学思想方法的渗透,切实增强学生对数学思想的认识、理解和运用能力,发散学生的思维方式,提升数学水平,充分发挥数学思想方法的重要作用,提
目的探讨尿中性粒细胞明胶酶相关载脂蛋白(NGAL)、尿N-乙酰-β-D氨基葡萄糖苷酶(NAG)和血清胱抑素C对对比剂急性肾损伤(CI-AKI)的早期诊断价值。方法前瞻性收集行冠状动脉造
现代信息技术的发展为教育带来了巨大的机遇和挑战,信息技术与地理教学的有机整合是当今教学的新趋向。本文从“运用现代信息技术进行地理教学的优势、教学中可能产生的误区、