甜杨抗冻转录因子ICE1基因的insilico克隆及其分析

来源 :分子植物育种 | 被引量 : 0次 | 上传用户：kanoabin

【摘要】

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ICE1基因编码类似MYC的bHLH转录因子,可特异地结合到CBF3启动子的MYC作用元件并诱导CBF/DREB1下游基因的转录表达。本文采用电子克隆的方法,以拟南芥ICE1蛋白序列为信息探针,

【作者】

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林元震张志毅刘纯鑫郭海朱保庆陈晓阳

【机构】

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华南农业大学林学院,北京林业大学林木花卉遗传育种教育部重点实验室,水利部水土保持植物中心

【出处】

：

分子植物育种

【发表日期】

：

2007年3期

【关键词】

：

PsICE1 in silico克隆甜杨转录因子抗冻性 PsICE1 in silico cloning Populus suaveolens Tr

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ICE1基因编码类似MYC的bHLH转录因子,可特异地结合到CBF3启动子的MYC作用元件并诱导CBF/DREB1下游基因的转录表达。本文采用电子克隆的方法,以拟南芥ICE1蛋白序列为信息探针,利用杨树EST数据库和毛果杨基因组序列拼接的结果,设计引物并通过RT-PCR从甜杨克隆了杨树的第一个ICE1基因。其cDNA长1706bp,含有完整的开放阅读框,可编码543个氨基酸的MYC类蛋白。编码蛋白序列含有bHLH区,核定位信号（NLS）区,富S区和转膜区各1个。Blast分析表明,cDNA序列及其推导的氨

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