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针对厌氧活性污泥微生物群落结构复杂。群落中相似基因序列较多等特点。对影响单链构像多态性（SSCP）图谱分辨率的电泳温度、甘油、交联度和影响聚合酶链式反应（PCR扩增）的BSA等因素进行了实验研究。结果表明，选择细菌16SrDNAV3区（约200bp）PCR扩增片段，在凝胶浓度为12％、丙烯酰胺与双丙烯酰胺质量比为49：1、无甘油等条件下。恒压260V，4℃电泳17h，可获得较为理想的SSCP图谱；BSA的使用，有助于降低样品中残留腐殖酸和棕黄酸等杂质对PCR扩增的抑制作用，提高SSCP图谱的分辨率和可读性