【摘 要】
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目的 比对云南省西双版纳地区新的百日咳临床分离株与疫苗株及其他地区流行的百日咳博德特氏菌基因特征，为百日咳的防控提供科学依据。方法 对2019年10—12月从云南省西双版纳州人民医院采集的4株百日咳临床分离流行株进行全基因组测序，利用MegAlign 7.1.0软件确定分离株的ptxP、ptxA、prn、fim3基因型，并与我国无细胞百日咳疫苗株CS株以及NCBI数据库中公开的其他国家和地区流行的
【基金项目】
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云南省创新疫苗技术与产业转化研发平台（202002AA100009）； 昆明市科技局重点项目（2019–1–N–25318000003332）；
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目的 比对云南省西双版纳地区新的百日咳临床分离株与疫苗株及其他地区流行的百日咳博德特氏菌基因特征，为百日咳的防控提供科学依据。方法 对2019年10—12月从云南省西双版纳州人民医院采集的4株百日咳临床分离流行株进行全基因组测序，利用MegAlign 7.1.0软件确定分离株的ptxP、ptxA、prn、fim3基因型，并与我国无细胞百日咳疫苗株CS株以及NCBI数据库中公开的其他国家和地区流行的百日咳博德特氏菌ptxP、ptxA、prn、fim3抗原基因特征进行对比分析；使用RAxML软件基于对28株百日咳博德特氏菌全基因组SNP构建系统发育树。结果 云南西双版纳4株百日咳临床分离株BP-L1、BP-L2、BP-L3、BP-L4基因组比CS株多产生了33～36个插入序列引起的基因重排。4株百日咳临床分离流行株的ptxP、ptxA、prn、fim3基因序列与CS株相似度在99.2%～100%。系统发育树结果显示，CS株与参考株TohamaⅠ聚为1支，形成独立进化分支；近年来全球流行的百日咳博德特氏菌分成2个聚类，BP-L1、BP-L4与多数欧美国家百日咳博德特氏菌聚为1支，主要为ptxP3/ptxA1/prn2型菌株，BP-L2、BP-L3与亚洲国家和地区的流行的百日咳博德特氏菌聚为1支，主要是ptxP1/ptxA1/prn1型菌株。结论 云南西双版纳临床分离株与疫苗株相比，主要毒力蛋白基因和进化分支发生了明显变化，与近年来国际流行的百日咳博德特氏菌遗传进化一致。
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