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黄山风景区有种子植物948种,隶属于120科483属,其中裸子植物3科6属6种。植物区系起源古老,孑遗植物、原始类群和中国特有类群丰富;单型或单种的科属众多,占总属数的61.70%;含10种以上的科和含6种以上的属分别占总科数和总属数的21.67%和4.25%,它们构成了黄山风景区的主体。该区植物区系以温带为主,兼有温带和亚热带的双重性质。