【摘 要】
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MicroRNA是调控基因表达的重要功能片段,它们在动植物的生长发育、疾病发生过程中发挥着重要的作用.基于miRecords数据库,以人类、小鼠和大鼠实验验证的miRNA和它们的靶mRNA
【机 构】
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内蒙古大学物理科学与技术学院,呼和浩特010021;内蒙古自治区农牧业科学院,呼和浩特010031;内蒙古医科大学计算机学院,呼和浩特010110;内蒙古农业大学理学院,呼和浩特010018
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MicroRNA是调控基因表达的重要功能片段,它们在动植物的生长发育、疾病发生过程中发挥着重要的作用.基于miRecords数据库,以人类、小鼠和大鼠实验验证的miRNA和它们的靶mRNA 3'UTR序列为研究对象,分析了 miRNA和其匹配片段在3'UTR序列上的位置偏好性.研究发现,miRNA与3'UTR序列相互作用的位置存在区域偏好.低G+C含量的miRNA主要作用在3'UTR序列的5'端和3'端,高G+C含量的miRNA主要作用在3'UTR序列的5'端.低G+C含量的匹配片段在3'UTR序列上没有明显的位置偏好,而高G+C含量的匹配片段集中分布在3'UTR序列的5'端.低配对率的匹配片段主要分布在3'UTR序列的两端,中等配对率的匹配片段主要分布在3'UTR序列的5'端.此外,还分析了miRNA与匹配片段的4种相互作用方式中配对率的差异.研究对于揭示miRNA对基因表达调控的多样性提供了新的思路.
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