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以沙鳅属Botia为外类群,共发现了副沙鳅属Parabotia 35个有系统发育意义的外部与骨骼形态特征,并由此重建副沙鳅属系统发育关系为:漓江副沙鳅+(双斑副沙鳅+(花斑副沙鳅+(武昌副沙鳅+点面副沙鳅)))或漓江副沙鳅+(双斑副沙鳅+(武昌副沙鳅+(点面副沙鳅+花斑副沙鳅))).具有囟门;后翼骨外侧面为不规则的梯形;吻骨侧面观呈一长方形;无下舌软骨;具有3对咽鳃骨;中喙骨弯曲较大,近直角;上吻皮中间有切刻状缺口,左右不连续;以及颐部无纽状突起等构成了副沙鳅属的共同离征.