【摘 要】
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目的 通过CRISPR(间区规律短回文重复序列)对陕西省鼠疫菌进行基因分型,分析流行病学特征,为陕西省鼠疫防治工作提供科学依据.方法 提取分离自陕西省鼠疫疫源地的66株鼠疫菌核酸,利用针对鼠疫菌的3对CRISPR引物进行PCR扩增,对扩增产物进行测序及分析,确定CRISPR基因分型.结果 66株鼠疫菌在3个位点上共有12种spacer,其中 YPa3种、YPb5种、YPc4种,具体为 a1′、a2′、a3′、b1′、b2′、b29′、b1″、b2″、c1、c2、c3、c3′,基因簇为 Cb2′,基因型分为
【机 构】
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陕西省疾病预防控制中心,西安 710054;澄城县疾病预防控制中心,澄城 715200
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目的 通过CRISPR(间区规律短回文重复序列)对陕西省鼠疫菌进行基因分型,分析流行病学特征,为陕西省鼠疫防治工作提供科学依据.方法 提取分离自陕西省鼠疫疫源地的66株鼠疫菌核酸,利用针对鼠疫菌的3对CRISPR引物进行PCR扩增,对扩增产物进行测序及分析,确定CRISPR基因分型.结果 66株鼠疫菌在3个位点上共有12种spacer,其中 YPa3种、YPb5种、YPc4种,具体为 a1′、a2′、a3′、b1′、b2′、b29′、b1″、b2″、c1、c2、c3、c3′,基因簇为 Cb2′,基因型分为 1′和4′两种.结论 疫情发生年份不同,鼠疫菌CRISPR基因型不同,鼠疫疫情处置进行溯源应将生态分型与基因分型结合.
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