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通过异构体结构的分析和重排反应和还原反应实验的证实,提出了红霉素E肟贝克曼重排反应产物中异构体转化机理,并对红霉素6,9-亚胺醚合成工艺条件进行了改进,优化后的工艺条件分别为:反应温度5℃、反应时间1 h、n(p-TsCl):n(EMAE-O)=1.5.红霉素6,9-亚胺醚产率达到93%,纯度为98%.