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对长周期永磁聚焦系统中电子注的脉动情况进行了系统的研究。在增大磁系统周期的时候，从理论上讨论了高次谐波，磁场参量和空间电荷参量对电子注脉动的影响，最后利用计算机仿真软件OPERA对电子注在长周期磁聚焦系统中的运动进行了模拟。结果表明，理论推导的结果与计算机模拟值相符，可以利用这种方法进行长周期聚焦系统的模拟和设计。