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代谢谱技术是指某一个代谢途径中超过一个基因被干扰后,对该途径中的某种特定的代谢产物进行定量分析。代谢谱技术已被广泛用于品种分类与真实性鉴定、基因功能、代谢调控与系统生物学研究、转基因农作物的安全性评价等方面,并在农作物成分改良方面具有广阔的应用前景。代谢谱技术最早主要用于拟南芥的研究,在水稻中的应用目前相对较少。本文主要从水稻代谢谱分析方法入手,简要概述了代谢谱技术在水稻代谢调控、基因组学、品种鉴定以及遗传育种方面的应用。