【摘 要】
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【目的】分析藤茶高通量转录组序列,从中挖掘出黄酮类化合物合成相关基因,为进一步揭示藤茶黄酮类化合物生物合成调控机制提供理论参考。【方法】分别采集藤茶的幼叶和成熟叶
【机 构】
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作物生物技术福建省高校重点实验室,福建农林大学农学院,福建省永春县林业局
【基金项目】
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国家科技支撑计划项目(2013BAD01B05),福建农林大学科技创新专项(KFA17424A)
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【目的】分析藤茶高通量转录组序列,从中挖掘出黄酮类化合物合成相关基因,为进一步揭示藤茶黄酮类化合物生物合成调控机制提供理论参考。【方法】分别采集藤茶的幼叶和成熟叶,提取其总RNA构建c DNA文库,采用Illumina HiSeqTM4000高通量测序平台对藤茶叶片进行转录组测序,经过滤处理后运用Trinity组装,将获得的Unigene与Nr、Nt、Pfam、Swiss-Prot、GO、KO和KOG 7个数据库进行比对注释,并预测Unigenes的编码区序列(CDS);基于KEGG信号通路富集分析,发掘
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