4种提取口腔产黑色素细菌DNA方法的比较

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目的比较4种提取口腔产黑色素细菌中间普氏菌DNA的方法,即酚-氯仿法、溴化十六烷基三甲铵(CTAB)提取法、Chelex-100提取法及试剂盒。方法分别记录OD260、OD230、OD280及OD340值;聚合酶链反应(PCR)电泳,检测提取DNA的浓度、纯度及对PCR反映体系的影响。结果试剂盒及CTAB法去除黑色素比较差异无统计学意义(P>0.05),两者与酚-氯仿及Chelex-100法比较差异有统计学意义(P<0.05);CTAB法提取DNA的浓度及纯度的效果要优于试剂盒,差异有统计学意义(P<0.05),PCR电泳条带清晰,无拖带。结论 CTAB法可有效去除黑色素及其他杂质,同时获得较高浓度的DNA样品;黑色素并不溶于氯仿/异戊醇混合液,对PCR反应体系有很大影响。
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